Dirección Ejecutiva
Como espacio oficial de la Red, la Presidencia trabaja de manera conjunta con las diversas instancias de Mercociudades, convocando y presidiendo específicamente las reuniones de trabajo del Consejo (órgano compuesto por ocho ciudades de cada país miembro del Mercosur, y por cuatro ciudades de cada país asociado, más la Comisión Directiva), las de la Dirección Ejecutiva, y las de la Asamblea General de Socios. En cada período esta Presidencia desempeña actividades en torno a un plan de trabajo aprobado en la cumbre anual de la Red. Acceda a mayor información sobre sus competencias en el Estatuto de Mercociudades.
Las vicepresidencias temáticas participan con derecho a voz y voto en la Dirección Ejecutiva, representan a la Red en diversos espacios regionales e internacionales y auxilian al Presidente en sus responsabilidades. Articulan y movilizan a las ciudades miembro coordinadoras o integrantes de las instancias temáticas de Mercociudades, afines al área temática que representan.

GOBERNANZA E INTEGRACIÓN CULTURAL (vicepresidencia compartida)
FRANCISCO LACERDA BRASILEIRO
Prefeito de Foz do Iguaçu – Brasil

GOBERNANZA E INTEGRACIÓN CULTURAL (vicepresidencia compartida)
MAYRA MENDOZA
Intendenta de Quilmes – Argentina
Es un organismo de apoyo de la Dirección Ejecutiva en las tareas de coordinación de la Red. La conforman la actual presidencia de Mercociudades, la anterior y la próxima.